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Heatmap: Cluster_188 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - Leiboff and Hake (2019))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.53 -2.39 -1.48 -1.93 -0.71 -1.21 0.27 0.21 -7.05 -7.67 -0.27 -0.31 1.38 0.94 0.75 1.32
0.2 -0.88 -1.33 -0.88 -0.74 -0.26 -0.05 0.1 0.0 0.7 0.68 0.06 0.48 0.19 -0.23 0.33
0.9 -0.83 0.1 0.45 0.1 0.24 0.25 -0.08 -0.44 -0.42 0.61 0.07 -0.34 -0.7 -1.0 -0.36
0.49 -0.23 -0.71 -0.65 -0.09 0.04 0.4 -0.68 0.44 0.07 0.82 0.5 -0.29 -1.04 -0.56 0.02
0.39 -1.08 -0.99 -0.72 -0.63 -0.49 -0.22 0.52 1.1 1.22 0.21 -0.67 -0.25 -0.38 -0.8 0.01
0.39 -1.41 -0.45 -0.62 -0.17 0.44 -0.03 -0.77 -0.59 -0.35 -0.14 -0.16 0.95 0.1 0.45 0.58
0.08 -0.16 1.02 1.38 0.79 0.52 -0.34 -1.16 -0.79 -0.56 -0.15 0.35 -1.2 -1.67 -1.74 -0.88
-0.36 -1.22 -1.72 -1.38 -2.05 -2.33 -0.02 1.83 1.84 1.77 -0.82 -0.59 -2.11 -2.37 -2.47 -1.77
0.34 -0.29 -0.34 -0.28 -0.13 -0.08 0.49 -0.24 -0.09 -0.32 0.72 0.33 -0.02 -0.35 -0.5 0.09
0.48 -0.64 -0.3 -0.09 -0.01 -0.15 0.67 0.27 -0.02 -0.21 0.23 -0.36 0.45 -0.58 -0.7 0.1
0.41 -1.09 0.11 0.25 0.23 0.52 0.03 -0.39 0.19 0.21 0.36 -0.1 -0.07 -0.49 -0.58 -0.54
0.44 -0.58 -1.24 -1.12 -0.76 -0.35 0.45 -0.4 -0.59 -0.27 0.18 -0.11 0.64 0.54 0.25 0.88
-0.02 -1.27 -0.49 -0.18 -0.6 -0.5 0.22 -0.38 -0.89 -0.81 -0.44 -0.35 1.03 0.42 0.7 1.05
-0.31 -0.19 -0.27 -0.19 0.05 0.08 -0.13 -0.02 1.18 0.84 0.44 0.57 -0.87 -1.33 -2.17 -0.83
0.64 -0.25 -0.57 -0.42 0.04 0.13 0.42 -1.0 -0.5 -0.69 1.08 0.56 -0.1 -0.45 -0.61 -0.03
0.74 -0.35 -1.17 -0.88 -0.42 -0.23 0.55 -0.53 0.4 0.59 0.64 0.39 -0.21 -0.56 -0.84 0.01
0.89 -2.95 -0.87 -1.65 -0.84 -0.73 -1.05 -0.57 -4.08 -3.85 -2.07 -2.13 1.8 1.21 0.7 1.49
0.96 0.34 -0.57 -0.44 -0.35 -0.1 -0.01 -0.51 -0.14 -0.39 -0.04 -0.98 0.46 -0.06 -0.63 0.87
-0.54 -1.32 -0.9 -0.98 -1.26 -1.96 0.2 1.95 0.06 0.7 0.02 -0.22 0.13 -0.35 -0.61 0.14
-0.02 -0.42 -0.07 0.25 0.23 -0.06 0.45 -0.15 0.02 0.04 0.8 0.51 -0.43 -0.91 -0.93 -0.46
-0.12 -0.73 -0.24 0.15 -0.63 0.08 -0.11 -0.47 0.42 0.37 0.74 -0.09 0.23 -0.18 -0.76 0.37
-0.76 -1.06 -0.47 -0.11 -0.97 -0.67 0.83 0.36 -0.46 -0.26 -0.19 -0.41 0.87 0.06 0.09 0.97
0.03 0.92 -0.31 -0.36 0.49 0.26 0.12 -0.28 0.26 0.13 0.23 0.35 -0.43 -1.28 -1.25 -0.58
-0.96 -1.9 0.99 1.37 1.23 0.91 0.09 -1.32 -3.13 -2.72 -0.26 -0.81 -0.21 -0.64 -0.71 0.21
0.51 0.07 -1.04 -1.84 -1.14 -0.94 0.0 -0.83 -0.23 0.28 0.19 0.04 0.55 0.47 0.29 0.95
0.33 -0.11 0.26 0.36 0.07 0.5 0.06 -0.93 -0.1 -0.07 0.55 0.02 -0.09 -0.67 -1.0 -0.2
0.59 -0.0 0.11 -0.16 0.01 -0.3 0.16 -0.49 -3.54 -2.79 0.34 0.45 0.53 0.0 -0.72 0.96
-0.75 -1.13 -0.38 -0.06 -0.16 -0.14 0.61 -0.24 0.09 -0.16 0.95 0.69 0.23 -0.32 -0.89 0.04
-0.66 -1.13 0.47 1.16 0.23 -0.04 1.48 -0.65 -1.07 -0.88 1.17 0.6 -1.64 -2.62 -2.86 -1.7
0.18 -0.44 -1.22 -0.76 -0.46 -0.57 0.4 -0.19 0.22 0.48 0.65 0.01 0.2 0.05 -0.3 0.46
0.02 0.21 -0.26 -0.24 -0.27 -0.18 0.69 -0.17 0.49 0.17 0.69 0.42 -0.64 -0.94 -0.7 -0.56
-0.58 -0.88 0.38 0.66 0.48 0.5 0.17 0.03 0.21 0.43 0.39 -0.34 -0.63 -1.0 -1.13 -0.43
1.04 0.34 -1.22 -1.63 -0.88 -0.68 0.43 0.01 0.34 -0.19 0.46 -0.17 0.26 -0.32 -0.35 0.27
0.33 0.27 -0.56 -0.59 -0.12 -0.26 0.58 0.92 -0.12 0.34 0.37 0.31 -0.49 -1.28 -1.02 -0.45
0.01 -0.94 -4.96 -4.12 -4.17 -3.22 -0.51 1.11 2.14 1.95 -0.27 -0.53 -1.17 -1.63 -2.68 -0.64
0.46 0.47 -0.11 -0.32 0.33 0.2 0.64 -0.25 0.54 0.01 0.31 0.55 -1.36 -1.74 -1.35 -1.09
0.79 -0.08 -2.16 -2.69 -1.68 -1.2 -0.68 0.29 0.48 1.63 0.01 -0.44 0.37 -0.18 -0.39 0.26
-0.25 -0.21 0.28 0.83 0.32 0.33 0.2 -0.31 -0.13 -0.63 0.63 0.71 -0.59 -1.15 -1.24 -0.81
-0.71 -1.32 0.71 1.37 0.09 0.24 -0.25 -0.68 0.33 0.66 -0.01 0.5 -1.02 -1.33 -1.55 -0.78
1.09 -0.57 -1.59 -1.18 -0.98 -0.3 0.32 -0.8 0.25 0.7 0.46 -0.58 0.36 -0.24 -0.1 0.44
-0.84 -0.69 0.62 0.82 0.65 0.37 0.17 -0.47 -0.02 -0.09 0.33 0.26 -0.44 -1.06 -1.15 -0.43
-0.83 -1.33 0.43 0.61 1.14 1.25 -0.49 -0.61 -0.03 -0.14 0.62 -0.27 -0.59 -1.42 -1.43 -0.84
0.62 -0.93 -1.1 -1.06 -0.86 -0.37 0.28 -0.67 -0.56 -0.41 0.4 0.21 0.73 0.58 0.13 0.73
-0.31 -0.57 -0.7 -0.22 -0.46 0.52 0.09 -0.06 0.28 0.29 0.29 0.21 0.19 -0.2 -0.34 0.31
0.92 -0.06 -0.98 -0.84 -0.68 -0.27 -0.11 -1.24 -0.5 -0.12 0.22 -0.05 0.46 0.42 0.08 0.81
-0.18 -0.43 -0.14 0.14 0.68 0.6 0.32 -0.3 0.47 0.5 0.7 0.3 -1.22 -1.46 -1.84 -1.15
0.14 -0.92 -0.36 0.02 -0.41 -0.12 0.48 0.07 0.24 0.22 0.62 0.1 0.1 -0.37 -0.71 0.06
0.38 -1.96 -2.04 -2.9 -1.71 -1.32 -0.1 0.64 -5.09 -4.56 -0.5 -0.34 1.45 1.1 0.66 1.51
0.47 0.04 -1.73 -1.44 -1.22 -0.55 -0.02 -0.6 0.31 0.43 0.81 -0.18 0.41 0.23 -0.04 0.55
-0.63 -0.68 -0.69 -0.41 0.11 -0.42 0.99 1.06 0.23 0.04 0.11 0.59 -0.47 -1.0 -0.59 -0.36
-0.05 -0.35 -0.13 0.35 -0.09 0.11 0.4 -0.48 0.37 0.28 0.66 0.34 -0.37 -0.85 -1.08 -0.24
-0.41 1.55 -2.75 -2.23 -0.77 -0.53 -2.53 0.75 0.85 -0.17 -2.08 -2.29 0.72 0.31 0.14 0.76
0.62 -1.65 -1.34 -1.9 -0.92 -0.61 0.26 0.13 -6.51 -5.45 -0.43 -1.27 1.34 1.09 0.56 1.43
-1.85 -2.57 0.69 0.88 1.18 0.65 0.44 -1.24 -1.17 -0.8 0.83 0.4 -0.78 -1.17 -0.79 -0.41
-0.52 -0.09 0.46 1.02 0.71 0.7 -0.38 -1.07 -0.23 -0.12 0.55 0.59 -0.74 -1.72 -1.93 -0.86
-1.06 -2.04 0.59 1.54 1.18 1.52 0.12 -1.47 -0.77 -0.89 0.43 -0.62 -1.42 -2.12 -2.53 -1.43
-1.61 -0.28 -1.71 -1.49 -2.36 -2.23 -1.82 0.96 2.39 2.2 -0.98 -0.64 -2.61 -3.26 -3.29 -2.47
-1.05 -1.41 0.91 1.08 0.22 0.58 -0.13 -0.54 0.24 -0.2 0.56 0.41 -0.87 -1.26 -1.46 -0.51
0.24 -0.64 0.99 1.18 0.94 0.65 0.31 -0.68 -1.09 -0.8 0.32 -0.37 -1.27 -2.4 -1.81 -0.73
-0.53 -1.75 1.38 1.92 0.16 1.5 -0.93 -1.7 -0.72 -0.44 -0.5 -0.99 -1.37 -1.8 -2.09 -1.43
1.76 -1.94 -0.98 -0.34 -0.06 -0.43 0.84 -1.27 -0.39 0.1 0.82 0.98 -1.06 -1.98 -1.86 -0.85
0.32 -1.38 -1.14 -1.69 0.78 -0.18 1.49 1.07 -2.49 -2.49 -1.05 -0.29 0.38 -0.15 0.11 0.22
1.09 -1.28 -1.01 -1.73 -1.37 -0.54 -0.01 -0.38 - - -2.73 -1.32 1.28 0.89 1.03 1.56
0.6 0.55 0.64 0.38 0.63 0.68 0.45 -0.36 -2.31 -1.89 -0.68 -1.13 -0.13 -0.35 -0.94 0.14
-0.37 0.57 -1.39 -1.16 -1.23 -0.59 0.5 -0.35 0.53 0.25 0.78 0.53 0.07 -0.13 -0.27 0.06
0.54 -0.79 -0.83 -0.58 -0.46 0.3 0.67 -0.52 -0.88 -0.23 0.44 -0.46 0.6 0.18 -0.25 0.6
0.51 0.1 -0.99 -0.53 -0.08 -0.37 0.17 -0.44 0.58 0.29 0.45 0.43 0.01 -0.5 -0.64 -0.09
-0.15 -1.1 0.09 0.12 0.18 -0.05 0.74 0.12 -0.14 -0.25 0.25 0.21 0.02 -0.44 -0.48 0.1
-1.33 1.04 -2.08 -1.69 -1.59 0.27 0.06 -1.01 -0.33 -0.32 0.58 0.18 0.73 0.07 0.26 0.84
0.83 -0.45 -0.35 -0.26 -0.24 0.21 0.24 -0.82 -0.17 0.56 0.58 0.08 -0.05 -0.69 -0.67 -0.02
-0.39 -1.19 0.57 1.13 0.45 0.74 0.06 -0.48 -0.41 -0.37 0.14 -0.5 -0.09 -0.75 -0.83 -0.15
-1.98 -3.41 2.02 2.32 1.04 1.34 -1.34 -2.19 -5.32 -3.95 -1.1 -1.41 -3.09 -3.78 -3.23 -2.7
0.98 -3.59 -3.04 -3.28 -1.27 -1.3 -0.24 -0.01 -3.89 -3.12 -0.96 -0.36 1.54 1.04 0.85 1.5
1.4 -1.73 -0.53 -0.62 -0.05 0.08 0.57 0.3 -1.82 -3.07 0.23 -0.52 0.51 0.15 -0.56 0.58
1.14 -0.32 -1.08 -0.52 -0.64 -0.09 0.29 -0.16 0.45 0.45 0.24 0.15 -0.04 -0.75 -0.48 -0.3
-0.22 -1.21 -1.27 -1.4 -1.07 -0.64 0.65 0.2 0.45 0.43 0.95 0.27 0.25 0.02 -0.16 0.17
0.01 -0.98 -0.36 -0.16 0.04 -0.22 -0.11 -0.6 -0.09 0.18 0.24 -0.02 0.53 -0.06 -0.01 0.76
-1.0 -1.91 0.15 0.6 -0.14 0.34 -0.36 -0.22 0.21 -0.35 1.6 0.46 -0.47 -0.86 -1.13 -0.49
0.55 0.63 -0.82 -0.63 0.38 0.37 0.3 -0.26 -0.14 -0.44 0.64 0.33 -0.44 -0.69 -1.0 -0.32
1.14 -1.38 -0.24 -0.61 -0.14 0.12 0.23 -0.82 -3.41 -4.11 -0.71 -1.21 1.03 0.44 0.45 1.15
-0.01 -0.99 -0.36 -0.17 0.02 -0.02 0.22 -0.33 -0.17 -0.15 0.79 0.43 0.39 -0.32 -0.8 0.41
-0.35 -0.41 -1.19 -1.09 -0.86 -0.33 0.88 0.75 0.91 -0.15 0.05 -0.14 0.1 -0.18 -0.25 0.23
0.25 -1.29 -1.4 -1.28 -1.08 -0.16 -0.13 -0.97 -0.42 -0.14 0.7 0.26 0.83 0.43 0.42 0.9
0.54 -1.09 -1.26 -1.4 -0.63 -0.1 0.43 -0.4 -0.52 0.09 0.62 -0.31 0.54 0.38 0.34 0.56
2.4 0.43 -1.91 -1.6 -0.44 -1.0 0.02 -0.51 -2.26 -2.11 -1.02 -0.73 0.42 0.07 -0.45 0.23
-0.38 -1.17 -0.1 0.18 -0.06 0.1 0.79 -0.35 -0.11 0.4 1.3 0.67 -0.79 -1.26 -1.91 -0.69
0.72 -0.2 -2.18 -2.08 -1.74 -1.11 0.09 0.34 -0.42 -0.58 -0.31 -0.54 1.02 0.3 0.44 1.26
-0.18 -0.38 -0.37 -0.53 -0.35 -0.73 0.74 0.36 0.76 0.22 0.89 0.64 -0.7 -1.25 -1.34 -0.27
1.33 0.1 -2.19 -2.16 -1.45 -0.82 -0.23 -0.82 -0.51 0.24 0.05 -0.22 0.81 0.43 -0.32 0.95
-0.52 -0.91 -0.18 0.2 0.05 0.08 0.6 -0.0 0.31 0.14 0.42 0.01 -0.14 -0.33 -0.6 0.12
0.83 0.75 -0.81 -0.34 -0.44 0.02 -0.07 -0.71 0.66 0.46 0.43 0.04 -0.39 -0.69 -1.19 -0.5
0.06 -0.1 -2.04 -0.59 -1.52 -1.25 0.29 -0.41 1.3 1.19 0.46 0.35 -0.42 -1.1 -1.67 0.51
0.26 -0.02 -0.26 0.35 -0.51 -0.0 -0.24 -0.48 0.6 0.39 0.22 -0.19 0.09 -0.42 -0.77 0.23
0.57 -0.88 -0.27 0.11 0.11 0.25 0.15 -0.07 -0.17 -0.01 0.31 -0.24 0.15 -0.22 -0.57 0.15
0.31 -1.33 -1.02 -1.29 -0.76 -0.06 0.03 -0.92 -1.0 -0.35 0.36 -0.34 1.07 0.54 0.31 1.14
-0.21 0.15 -1.54 -1.55 -1.32 -1.43 -0.66 -0.29 0.41 -0.53 -1.61 -1.21 1.31 0.98 0.59 1.26
-0.21 -0.57 -0.23 -0.31 0.33 0.3 0.47 -0.47 -0.14 -0.34 0.23 -0.3 0.78 -0.21 -0.69 0.4
-0.9 0.52 -0.3 -0.2 -0.03 -0.14 0.13 0.07 -0.26 -0.79 -0.71 -0.65 0.78 0.31 0.29 0.55
-1.15 -1.55 -0.64 -0.51 -0.37 0.38 0.61 0.08 0.44 -0.13 1.06 0.87 -0.26 -0.85 -0.74 0.05
-0.79 -1.82 -0.09 0.29 0.31 0.38 0.29 -0.02 -0.03 -0.14 0.52 0.12 0.17 -0.17 -0.52 0.15
0.38 0.01 -0.31 -0.25 -0.1 -0.09 0.36 -0.25 0.26 0.33 0.79 0.64 -0.63 -0.96 -1.09 -0.56
0.03 -0.33 -0.58 -0.18 -0.68 -0.19 0.28 -0.03 0.37 0.45 0.4 -0.41 0.14 -0.03 -0.43 0.48
0.76 -0.49 -0.47 0.19 -0.11 0.49 0.25 -0.44 0.17 0.45 0.4 -1.12 -0.19 -0.56 -0.84 0.13
-0.4 -0.15 -1.2 -0.85 -0.82 -0.11 0.98 -0.48 0.28 0.37 1.21 1.31 -1.1 -1.47 -2.03 -0.32
-0.13 -0.83 -0.4 -0.65 0.01 -0.22 0.45 -0.6 -4.46 -4.01 -0.75 0.07 1.1 0.49 0.75 1.17
-0.32 -0.78 -2.06 -2.62 -1.47 -0.95 -0.36 -0.95 -1.75 -0.88 0.89 0.86 0.97 0.73 0.5 1.33
0.1 -6.61 -0.24 0.25 0.96 -0.62 -0.47 -0.76 -6.1 -5.23 -2.42 -2.04 1.15 0.87 0.65 1.53
-0.61 -1.6 -0.16 0.23 -0.22 -0.12 0.68 0.07 -0.29 -0.14 1.05 0.6 -0.09 -0.4 -0.79 -0.11
-0.18 -1.03 0.33 0.36 0.08 0.38 0.12 -0.51 0.41 0.49 0.79 0.08 -0.43 -0.94 -1.41 -0.38
0.0 -1.21 -0.11 0.24 0.58 0.26 1.1 -0.18 -2.8 -3.07 1.05 0.91 -0.59 -0.98 -0.71 -0.43
-1.69 -1.33 0.36 0.25 0.83 0.39 1.25 -1.42 -3.96 -2.98 0.86 0.12 0.13 -0.19 -0.5 0.26
0.84 0.45 -0.65 -0.27 -0.35 -0.36 0.3 -0.7 0.25 0.19 0.77 0.63 -0.67 -1.02 -1.47 -0.13
-0.15 -0.74 0.18 0.56 0.11 0.31 0.03 -0.05 0.55 0.13 0.47 0.0 -0.31 -0.86 -0.86 -0.46
0.1 -0.88 0.75 1.05 0.63 0.58 0.55 -0.14 -0.69 -0.53 0.28 -0.78 -0.62 -1.25 -1.21 -0.73
0.96 -0.9 -0.11 0.04 0.25 0.76 -0.42 -0.85 -0.22 -0.04 0.18 -0.46 0.3 -0.34 -0.38 -0.15
0.65 -1.34 -1.95 -1.64 -1.34 -0.71 0.48 0.84 -0.62 -0.26 -0.04 -0.92 1.0 0.59 -0.37 1.0
1.59 -1.99 0.51 1.08 0.31 0.94 -0.83 -0.96 -5.21 -4.2 -2.64 -2.55 0.47 -0.06 0.06 0.22
-0.76 -0.18 0.31 0.77 0.24 0.26 0.22 -0.12 -0.15 0.1 0.11 0.12 -0.26 -0.76 -0.58 -0.19
0.36 -0.96 -0.2 -0.2 -0.12 -0.22 0.63 -0.45 -0.06 0.34 0.45 -0.35 0.31 -0.25 -0.34 0.2
0.53 -1.06 -2.03 -2.06 -1.26 -0.7 -0.7 -1.1 -0.77 -0.94 -0.62 -1.44 1.5 1.04 0.87 1.4
0.21 -1.15 -1.42 -2.1 -0.94 -0.82 0.1 -0.01 -0.6 -1.34 0.54 0.43 1.02 0.64 0.24 1.01
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-0.19 -1.66 0.04 0.7 -0.19 0.15 -0.09 0.34 -3.84 -2.05 1.58 1.03 -0.61 -0.41 -1.45 -0.23
-0.49 0.74 -0.27 -0.69 -0.29 -0.11 -0.03 0.18 -0.86 -1.09 0.39 0.23 0.44 0.19 -0.03 0.41
0.83 -0.12 -0.64 -0.35 -0.39 0.02 0.17 -0.71 -0.0 0.06 0.62 0.18 0.1 -0.25 -0.61 0.1
-0.39 0.37 -0.96 0.0 -0.23 -0.27 0.56 0.13 0.62 0.42 0.79 0.26 -0.31 -0.94 -1.59 -0.46
-1.32 -1.05 1.01 1.07 1.22 0.55 0.56 -0.93 -2.48 -2.42 0.07 0.39 -0.56 -0.76 -1.13 -0.37
0.47 -0.6 -0.47 -0.34 -0.16 -0.09 0.01 -0.42 0.18 0.23 0.78 0.6 -0.01 -0.51 -0.65 -0.02
0.1 - 0.27 -1.22 0.02 -0.3 0.02 0.12 - - -2.86 -1.63 1.22 1.04 1.12 1.24

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.