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Heatmap: Cluster_71 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - Leiboff and Hake (2019))

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Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
2.48 0.72 0.88 0.42 1.13 1.02 1.45 4.64 2.21 2.13 1.31 0.69 7.16 4.23 2.86 3.91
0.13 6.6 22.65 45.97 41.86 135.78 103.04 50.39 174.96 174.26 111.73 36.06 1.18 0.53 0.55 0.72
2.84 2.67 1.64 0.9 2.23 2.9 1.68 0.91 0.68 0.8 0.92 1.17 1.73 1.81 1.36 3.6
0.0 0.0 5.82 3.4 5.32 4.67 0.31 0.6 0.0 0.1 0.5 0.0 1.64 0.55 1.85 1.08
2.53 1.43 0.03 0.1 0.62 0.58 0.49 7.51 14.57 23.79 0.04 0.23 1.94 1.63 0.95 2.76
1.47 0.23 0.15 0.0 0.0 0.0 0.5 1.12 3.4 1.97 1.26 0.15 0.85 0.71 0.37 1.81
1.06 0.98 7.62 6.04 5.39 5.71 4.98 2.03 1.74 1.72 3.37 2.27 3.35 0.92 1.55 1.99
1.44 1.35 0.25 0.4 1.06 1.28 2.81 2.59 6.38 5.23 2.29 1.64 2.44 1.37 0.59 2.02
0.01 0.13 0.32 0.16 0.43 0.01 0.09 0.0 0.05 0.02 0.07 0.07 0.69 0.16 0.17 0.28
0.09 0.42 1.61 2.32 1.59 1.18 1.26 0.76 5.18 1.64 3.6 0.56 3.08 1.51 0.81 1.86
0.15 0.03 0.5 0.33 0.94 0.99 0.24 0.21 0.07 0.06 0.23 0.11 1.04 0.5 0.44 0.5
20.31 9.17 13.08 17.61 10.51 10.56 23.77 14.49 18.99 21.49 20.34 11.08 16.05 13.68 13.13 18.74
0.32 0.66 6.04 7.12 9.3 8.0 0.68 0.64 0.22 0.37 0.31 0.3 1.23 0.73 0.91 0.55
0.1 0.19 0.62 0.59 1.53 1.96 0.18 0.06 0.15 0.19 0.42 0.06 1.46 0.76 0.91 0.57
4.29 1.69 78.33 76.63 56.45 65.47 19.24 85.36 48.68 54.66 55.01 47.76 0.67 0.38 0.43 0.24
5.34 5.4 2.31 2.98 3.8 3.6 7.77 2.88 6.62 7.81 9.37 7.07 5.34 5.0 3.74 6.65
1.33 0.59 1.21 0.89 1.36 1.38 2.48 1.66 1.3 1.75 2.59 2.53 7.35 4.83 3.69 5.6
0.2 0.02 4.42 5.46 5.03 3.91 0.49 0.38 0.18 0.14 0.35 0.18 1.22 0.45 0.82 0.31
5.02 0.28 6.95 6.4 5.18 13.82 3.73 2.07 0.43 3.12 4.21 1.73 18.07 11.44 18.8 6.83
0.0 0.0 2.57 3.71 0.2 0.36 1.07 0.78 0.0 0.0 0.0 0.09 3.67 0.86 1.8 0.42
15.65 8.91 12.25 12.32 8.38 10.59 10.63 6.27 5.13 6.0 7.27 6.59 19.93 16.98 22.86 18.79
6.74 3.59 1.47 2.15 4.52 3.56 11.11 5.14 9.7 9.04 10.33 7.43 5.84 4.08 2.3 7.65
0.93 4.98 22.27 16.23 27.96 11.53 9.06 4.67 0.0 0.06 5.53 8.72 0.82 0.06 0.0 0.38
1.46 0.81 0.72 0.81 1.46 1.7 1.37 0.83 1.4 1.98 2.24 1.23 3.0 2.97 1.82 2.97
2.8 1.46 0.72 0.49 0.4 1.23 1.2 5.14 25.21 32.52 2.16 1.76 4.6 2.15 1.44 2.5
0.13 0.46 0.29 0.15 0.06 0.17 0.0 0.0 0.35 0.27 0.0 0.26 0.87 0.41 0.43 0.8
0.33 28.02 0.44 0.18 0.84 0.34 0.46 0.07 0.0 0.0 0.0 0.11 0.07 0.14 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.22 0.68 0.43
4.25 6.83 22.09 14.94 0.0 0.0 0.65 1.99 122.12 142.94 121.24 142.66 21.56 16.6 3.81 21.76
5.48 2.43 4.1 4.35 4.37 5.54 1.62 6.96 22.3 18.38 3.7 5.08 6.19 4.55 3.33 5.35
2.5 0.66 1.05 0.54 2.02 2.87 1.44 1.09 0.5 0.64 1.63 0.68 4.49 3.22 2.29 3.53
8.9 23.59 1.03 1.93 1.66 2.77 1.32 0.6 0.25 0.38 0.24 0.27 3.85 2.48 1.96 2.88
2.0 0.38 0.4 0.35 0.63 0.94 0.59 0.49 1.08 0.77 0.6 0.84 1.94 1.27 0.76 1.07
0.78 0.25 6.79 4.86 2.69 2.51 1.3 3.32 3.4 2.4 1.3 0.84 2.99 2.24 1.17 3.84
13.14 7.22 20.29 27.28 25.05 22.01 4.87 3.44 1.74 0.63 3.7 3.26 8.39 4.6 2.23 2.04
5.58 1.04 13.27 9.01 23.16 26.58 12.68 9.13 3.2 3.12 7.84 4.66 50.41 23.91 24.99 33.76
0.99 0.77 63.66 84.62 36.31 35.05 9.55 0.57 0.31 0.51 4.55 7.16 1.7 1.49 0.22 1.15
1.71 0.33 7.32 10.25 15.44 13.04 1.71 1.51 3.53 6.77 2.12 1.48 2.8 2.59 1.3 3.87
0.0 0.0 0.25 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.57 0.0 0.0 1.64
1.32 0.22 1.71 1.23 1.02 1.2 0.77 0.65 0.46 0.31 0.89 0.85 2.43 2.54 1.79 2.37
6.04 7.1 29.69 30.54 29.71 18.03 12.32 7.36 9.82 9.21 12.86 13.3 6.5 3.6 2.95 7.02
0.14 4.13 9.58 7.23 1.57 2.3 18.44 0.88 0.36 0.53 0.0 0.1 0.0 0.0 0.25 0.24
0.0 0.0 0.12 0.12 1.03 0.84 0.34 1.15 0.04 1.53 0.24 0.22 1.21 0.66 0.55 0.69
0.09 0.19 0.03 0.0 0.0 0.09 0.02 0.08 0.18 0.05 0.05 0.0 1.91 0.98 0.22 0.21
2.21 0.88 0.68 0.95 0.98 1.45 2.35 1.64 3.81 2.97 3.54 2.42 2.55 2.68 1.91 3.57
5.34 2.03 3.23 2.77 3.2 4.32 8.23 3.49 11.9 8.54 14.57 4.93 7.93 5.56 4.67 5.82
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1.91 1.06 1.15 1.82 1.77 2.79 1.49 0.68 0.38 0.58 1.67 1.96 3.27 1.98 0.87 2.84
0.0 0.0 0.29 0.18 0.73 0.89 0.3 0.05 0.09 0.12 2.59 2.39 1.91 1.03 0.66 1.01
5.36 2.48 0.86 1.82 3.96 4.91 7.48 4.48 12.35 16.26 18.03 9.93 5.31 3.62 2.4 5.6
3.44 5.94 62.67 66.16 31.01 92.18 11.68 22.07 7.69 13.41 23.82 26.42 0.71 0.35 0.61 1.01
0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 1.65 0.89 2.73 2.79 4.17 2.54 1.79 0.64 0.28 0.92
0.26 0.02 0.8 1.22 1.25 1.22 0.44 0.36 0.49 1.22 6.89 5.19 0.71 0.55 0.92 1.5
7.29 9.89 14.39 17.44 15.74 16.87 11.87 7.44 13.65 14.89 16.01 18.44 6.75 4.88 1.99 5.55
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 9.74 6.84 0.0 4.1
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0.0 0.81 0.11 0.32 0.0 0.1 0.11 1.27 0.43 0.11 0.0 0.0 1.35 0.5 0.53 0.5
2.44 1.7 5.55 6.58 6.7 7.18 6.1 5.03 3.77 2.62 3.23 1.15 11.66 6.18 5.15 10.71
0.85 0.17 1.98 2.37 1.57 1.49 0.9 0.65 1.3 1.44 1.23 0.81 1.99 0.89 2.05 0.96
1.49 0.21 1.02 0.77 1.87 2.35 0.8 0.53 0.26 0.27 1.71 1.13 1.66 2.0 1.05 1.09
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0.89 0.3 32.89 32.03 57.5 72.5 2.09 4.03 0.47 0.25 5.03 2.92 2.61 0.95 1.71 3.73
3.08 21.71 1.49 0.83 1.43 0.75 3.98 1.5 0.72 0.54 0.84 0.52 7.94 3.99 4.92 6.49
0.04 0.32 0.14 0.03 4.63 5.02 2.4 3.3 2.23 0.97 0.78 0.36 1.13 0.58 0.61 1.45
2.36 0.0 14.88 25.81 11.64 14.19 0.07 0.15 1.51 1.25 2.87 2.18 1.97 1.26 1.15 2.01
11.57 8.11 12.32 12.5 7.89 10.35 38.16 235.93 260.9 354.14 18.02 16.1 5.4 3.25 3.66 4.1
3.11 0.78 1.17 0.6 1.85 2.04 0.88 1.34 2.4 4.01 0.98 0.67 3.14 2.02 1.41 4.37
2.06 0.98 0.69 0.78 1.57 1.49 1.04 3.32 7.94 18.36 1.95 1.86 3.39 2.67 2.75 5.29
0.85 0.48 17.37 20.86 21.95 26.96 16.14 2.93 4.19 8.09 70.98 38.21 9.35 3.75 2.63 4.91
1.61 0.69 0.69 0.66 1.29 2.22 1.56 1.0 0.86 1.26 2.74 2.39 3.33 3.56 2.87 2.89
0.19 5.11 1.48 0.6 1.52 1.23 1.93 0.2 0.0 0.0 0.57 0.74 0.36 0.17 0.0 0.58
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1.63 2.9 0.76 0.48 1.25 0.83 1.78 5.67 9.33 14.65 1.28 2.63 1.93 1.97 0.94 2.65
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1.62 5.66 9.86 4.89 11.26 9.14 3.97 3.73 4.13 0.1 0.21 1.4 21.23 16.48 21.6 12.15
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1.75 1.3 13.97 15.46 7.94 7.65 24.59 31.37 42.95 35.71 14.14 5.44 16.43 2.47 3.4 11.22
2.18 0.49 0.23 0.78 0.72 0.04 0.45 10.37 18.66 48.76 0.13 0.12 1.36 0.94 1.1 1.91
0.49 0.4 5.87 9.07 8.58 10.57 5.14 10.01 4.12 7.64 4.95 3.29 11.16 3.21 3.9 5.62
2.96 2.49 1.24 0.71 1.25 1.92 1.92 1.53 1.67 1.96 2.78 2.48 4.87 4.02 2.35 6.46
5.68 4.78 5.12 6.25 6.19 9.56 6.99 24.18 35.36 47.58 10.36 5.29 5.41 2.46 5.05 6.98
13.73 19.93 26.69 25.15 15.81 20.08 13.23 5.11 5.18 4.68 17.7 16.56 7.87 8.81 6.73 9.9
0.07 0.06 0.09 0.13 0.25 0.17 0.04 0.02 0.03 0.05 0.03 0.0 1.53 0.4 0.39 0.49
2.84 2.05 4.88 3.58 7.07 10.26 4.03 5.22 12.84 14.84 7.36 6.9 3.01 2.58 2.45 3.97
5.9 0.34 0.34 0.31 0.46 0.85 0.25 0.2 0.12 0.14 0.3 0.18 1.18 0.88 0.35 1.03
0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.21 0.34 0.11 0.11 2.66 0.99 1.57 1.95
0.32 0.1 4.05 3.99 5.35 3.48 2.0 1.42 0.34 0.24 0.58 0.85 4.67 1.89 1.47 3.44
10.29 9.44 1.54 0.59 1.07 1.18 1.46 0.79 0.72 0.43 1.14 0.27 4.13 3.33 2.76 4.52
0.84 0.0 10.97 7.28 1.99 27.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 138.58 0.0 0.0 70.67
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Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)