1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_26 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - Leiboff and Hake (2019))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.38 0.72 0.0 0.32 0.03 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 28.83 40.19 21.54 19.76 32.75 0.43 0.0 0.0 7.81 12.59 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.15 1.91 0.09 0.15 0.07 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.09 88.2 91.46 130.84 139.88 318.57 56.78 0.0 0.0 249.45 144.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.09 0.12 0.63 1.1 0.27 1.32 0.02 0.0 0.0 0.03 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 293.71 447.5 323.53 309.48 2.44 0.02 0.0 0.0 18.02 13.56 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 8.27 10.07 13.32 5.87 2.31 0.4 12.77 23.53 18.33 25.12 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 9.66 3.72 10.76 3.18 10.12 0.33 0.0 0.0 0.91 1.64 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.15 0.29 0.41 0.24 0.04 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.06 0.0 0.63 1.8 0.14 0.6 4.49 1.17 1.66 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 4.88 0.07 0.33 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.85 4.89 0.42 0.46 2.32 2.85 0.02 0.0 0.07 0.04 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 1.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.75 4.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.23 0.23 0.0 0.0 0.03 18.96 499.75 264.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
9.61 20.53 2141.07 1755.83 1393.94 793.46 213.47 202.88 4.91 3.51 70.94 317.56 0.0 0.07 0.27 0.0
0.03 1.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.17 1.29 0.33 0.02 0.35 0.02 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.0 0.08 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.19 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.09 0.0 0.19 0.34 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.28 2.23 3.77 8.08 1.89 1.34 0.59 0.77 0.91 1.09 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0
0.53 0.08 2.36 1.33 0.12 0.06 0.07 0.1 3.97 5.59 0.68 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0
1.18 0.0 59.39 6.95 8.75 0.91 0.12 0.07 0.08 0.04 0.21 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.38 0.64 0.07 0.12 0.0 0.05 0.1 0.0 0.2 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.88 0.37 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0
0.05 73.03 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.31 0.03 0.22 2.91 0.18 0.0 0.0 0.08 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.21 0.09 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.0 0.15 0.08 0.1 0.71 1.6 0.01 0.0 0.0 0.05 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 28.67 65.63 45.71 27.45 4.79 0.97 8.92 7.47 4.2 2.74 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.22 0.02 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.27 12.46 13.29 7.84 8.04 2.75 0.0 0.0 0.0 0.14 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 2.1 0.0 0.3 0.0 0.03 0.15 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 1.48 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.51 0.3 0.2 0.37 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.15 1.63 3.44 3.54 2.82 28.65 22.64 1.77 11.39 33.82 151.44 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.36 0.07 0.06 0.05 0.0 0.0 0.16 1.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.84 12.38 11.13 7.58 10.08 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.22 0.09 0.0 0.0 0.0 0.45 44.84 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 11.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.36 0.54 1.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.16 44.02 36.97 59.88 24.74 23.51 3.12 171.51 112.61 414.57 803.43 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.1 0.25 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.08 0.14 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.05 0.02 0.0 0.51 0.1 0.85 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 1.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 14.8 0.0 0.1 0.51 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 13.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
5.15 2.35 0.33 0.07 0.18 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.03 0.0 0.15 0.0 0.03 16.57 0.08 0.0 6.26 12.65 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 1.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.06 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.56 0.04 0.55 0.11 0.1 0.0 0.0 0.06 0.15 0.13 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 3.76 25.99 36.56 47.39 30.03 39.82 22.39 12.26 43.39 46.33 44.32 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.18 0.46 0.46 2.57 0.19 71.19 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.23 0.49 7.51 0.15 0.63 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
4.15 733.31 33.37 19.21 29.62 18.44 27.52 0.79 4.02 8.56 2.94 11.33 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.91 4.14 0.03 0.01 6.83 0.05 0.0 0.0 1.72 0.54 0.0 0.04 0.0 0.0
11.64 0.0 0.0 0.06 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0
0.0 0.15 0.32 0.41 1.32 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.26 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 126.78 0.37 1.58 0.16 0.0 0.0 1.42 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
14.62 1.08 0.0 0.0 0.14 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.43 18.18 60.87 44.32 15.22 40.83 1.07 0.17 0.76 12.62 11.96 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 4.73 5.44 11.4 4.94 13.28 19.02 168.04 157.14 61.31 51.23 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.13 0.05 0.29 0.47 0.04 0.0 0.16 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)