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Heatmap: Cluster_41 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - Leiboff and Hake (2019))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
1.11 -0.56 -0.56 -1.35 -0.64 -0.44 0.31 -0.78 -1.21 -1.05 0.36 0.33 0.19 0.37 0.82 0.29
0.62 -0.19 -0.06 -0.74 -0.35 -0.3 0.15 -0.6 -1.17 -1.36 -0.49 -0.18 0.31 0.64 0.93 0.62
0.33 -0.71 0.38 -0.12 0.17 0.22 -0.0 -0.48 -2.09 -2.49 -1.42 -1.07 0.47 0.71 1.03 0.67
0.32 -1.03 0.07 -0.17 -0.16 0.09 0.36 -0.37 -1.05 -1.17 -0.29 0.07 0.27 0.52 0.88 0.05
1.2 0.63 -0.67 -1.74 -0.3 -0.49 0.46 -0.64 -0.88 -1.39 -0.57 -0.17 0.05 0.5 0.81 -0.01
0.92 -0.46 -0.28 -0.53 -0.45 -0.31 0.38 -1.0 -0.91 -1.29 -0.48 0.04 0.15 0.53 0.99 0.37
0.26 -1.06 -0.43 -1.79 -0.58 -0.52 0.22 -0.25 -1.72 -2.04 -0.8 -0.44 0.81 0.97 1.56 0.49
0.6 0.21 -0.81 -1.2 -0.69 -0.51 0.27 -0.54 -0.76 -0.98 -1.13 -0.66 0.64 0.87 1.14 0.42
0.57 0.09 -0.1 -1.14 -0.68 0.09 -0.74 -1.32 -1.67 -2.11 -1.21 -0.88 0.8 1.01 1.25 0.78
1.36 0.84 -0.28 -0.48 0.64 0.35 0.39 -0.63 -1.4 -1.86 -0.88 -0.23 -0.55 -0.39 0.28 -0.77
0.7 0.19 -1.54 -2.06 -1.64 -1.93 0.72 0.08 0.8 0.24 0.63 1.26 -0.92 -0.7 -0.44 -0.67
0.02 -0.36 0.18 -0.54 0.14 0.2 -0.16 -0.93 -1.78 -2.19 -0.99 -0.66 0.62 0.81 1.2 0.57
0.58 -0.24 0.12 -0.51 0.01 0.15 -0.11 -0.72 -1.29 -1.66 -0.71 -0.5 0.58 0.52 1.04 0.25
0.8 1.02 -0.79 -0.96 -0.52 -0.46 0.24 -0.69 -0.39 -0.95 -0.12 0.27 -0.01 0.18 0.32 0.18
0.52 -0.48 0.14 -0.63 -0.08 0.25 0.1 -0.52 -1.61 -2.06 -0.68 -0.43 0.45 0.83 1.01 0.14
0.91 -0.28 -0.33 -1.08 -0.41 -0.46 -0.05 -0.57 -1.1 -1.47 -0.47 -0.21 0.49 0.57 1.18 0.42
0.08 -0.51 -2.05 -3.14 -2.14 -2.03 -0.27 -0.72 -1.48 -1.47 -0.83 -0.66 1.24 1.39 1.82 0.64
1.15 -0.32 -1.0 -2.35 -1.2 -1.24 -0.22 -0.87 -1.74 -1.56 -1.17 -0.58 0.81 1.06 1.49 0.7
1.06 0.3 -0.51 -1.04 -0.34 -0.47 0.23 -0.29 -0.41 -0.9 -0.92 -0.41 0.25 0.45 0.69 0.32
-1.28 -6.42 -0.76 -1.54 -1.09 -1.15 -0.29 -1.32 - -8.27 -2.56 -1.65 1.62 1.73 1.85 1.0
1.18 -0.08 -0.83 -1.93 -0.42 -0.74 -0.51 -1.56 -3.43 -3.14 -1.44 -1.01 1.01 1.01 1.51 0.69
1.37 0.73 -0.68 -1.43 -0.57 -0.29 -0.01 -1.36 -0.74 -0.71 -0.53 -0.22 0.21 0.36 0.72 0.04
0.24 -1.01 -0.44 -0.67 -1.25 -0.9 0.87 -0.29 -1.24 -1.5 -0.09 0.21 0.31 0.94 1.15 0.15
0.75 -0.42 -1.49 -1.88 -1.61 -1.4 0.55 -0.08 0.32 0.09 0.23 0.24 0.21 0.32 0.57 0.33
0.99 -0.35 -0.06 -0.92 -0.18 0.04 -0.17 -0.86 -1.56 -1.97 -0.84 -0.48 0.59 0.61 1.22 0.21
-0.01 0.2 -1.07 -2.04 -0.94 -1.06 0.61 -0.26 -1.56 -2.09 -0.96 -0.81 0.92 1.05 1.18 0.92
0.58 -1.26 0.43 -0.06 0.25 0.36 -0.01 -1.68 -1.53 -1.89 -0.63 0.11 0.07 0.4 1.07 0.28
0.92 -0.36 -0.68 -1.7 -0.77 -0.67 0.17 -0.36 -0.99 -1.55 -0.15 0.12 0.47 0.88 1.16 -0.02
1.4 0.02 -0.81 -1.18 -1.22 -0.78 0.33 -0.8 -0.77 -0.91 -0.43 -0.21 0.15 0.55 0.86 0.46
0.75 0.73 -1.46 -1.94 -1.17 -1.05 0.74 -0.46 -0.63 -0.51 -0.05 0.31 0.27 0.34 0.76 0.0
0.45 -0.23 -1.22 -2.17 -0.7 -0.67 0.04 -0.61 -2.65 -3.21 -1.66 -1.35 1.01 1.26 1.85 0.25
0.86 0.1 -0.26 -0.99 -0.82 -0.41 -0.08 -0.82 -0.79 -0.85 -0.44 0.08 0.44 0.28 0.96 0.59
0.68 -0.94 -0.51 -0.77 -0.63 -0.11 0.12 -0.75 -1.41 -1.67 -0.58 -0.55 0.66 0.96 1.32 0.35
0.64 -0.34 0.06 -0.32 -0.26 0.15 0.29 -0.67 -1.0 -1.3 -0.1 0.15 0.09 0.35 0.74 0.07
0.95 0.52 -0.48 -0.96 0.05 0.02 0.41 -0.28 -0.91 -1.44 -0.63 -0.02 -0.18 0.28 0.6 0.07
1.18 0.54 -0.27 -0.0 0.49 0.49 0.33 -0.27 -1.21 -1.31 -0.96 -0.43 -0.4 -0.11 0.03 -0.39
0.01 -0.8 0.38 0.26 0.33 0.58 0.2 -0.5 -0.91 -1.12 -0.16 0.11 -0.26 -0.01 0.6 0.01
0.16 -1.92 0.3 -0.82 0.05 0.14 0.35 -0.57 -1.19 -1.41 -0.51 0.06 0.39 0.53 1.18 0.21
1.17 0.78 -0.37 -1.07 -0.75 -0.48 0.02 -0.62 -1.63 -2.22 -1.34 -0.98 0.47 0.63 1.13 0.31
0.75 -0.3 -0.98 -1.97 -1.21 -0.9 0.35 -0.42 -1.95 -2.25 -0.9 -0.71 0.99 1.02 1.34 0.68
0.14 -0.21 -0.75 -1.25 -0.82 -0.33 0.34 -0.49 -0.79 -1.15 -0.36 -0.19 0.63 0.72 1.15 0.67
-4.25 -2.98 - - - - - - -6.41 -7.35 - - 1.79 1.85 2.18 2.08
0.53 -0.67 -0.04 -0.95 -0.24 -0.19 0.01 -0.53 -1.01 -1.34 -0.86 -0.51 0.58 0.83 1.18 0.42
1.04 0.43 -0.26 -0.92 -0.41 -0.09 0.39 -0.47 -0.98 -1.4 -0.25 0.0 -0.03 0.25 0.71 -0.03
0.04 -0.93 -0.11 -0.56 -0.57 -0.35 0.06 -0.74 -1.24 -1.79 -0.24 0.02 0.68 0.89 1.12 0.62
0.51 0.5 -0.87 -1.87 -0.86 -0.71 0.37 -0.58 -0.81 -0.82 -0.29 -0.29 0.54 0.74 1.0 0.41
0.97 -0.29 -0.68 -1.49 -0.87 -0.62 0.46 -0.61 -0.95 -1.05 -0.34 0.03 0.31 0.69 1.0 0.43
1.25 0.71 -1.81 -1.85 -1.32 -1.57 0.53 -0.53 0.46 0.34 0.38 0.27 -0.55 -0.5 0.16 -0.14
-0.21 -0.65 0.31 -0.57 0.02 0.12 -0.09 -0.85 -1.41 -2.19 -0.74 -0.43 0.7 1.03 1.08 0.35
1.84 0.8 -0.3 -0.7 -0.64 -0.51 0.38 -0.79 -2.8 -2.26 -0.96 -0.19 -0.15 0.2 0.55 -0.38
0.93 0.65 -0.68 -1.33 -0.48 -0.28 -0.24 -0.82 -1.4 -1.49 -0.57 -0.2 0.65 0.67 0.94 0.25
1.04 -0.53 -0.52 -1.14 -0.63 -0.61 0.27 -0.49 -1.37 -1.67 -0.77 -0.33 0.51 0.61 1.37 0.32
0.82 -0.13 -0.72 -1.69 -0.83 -0.93 -0.15 -0.79 -2.32 -2.58 -1.34 -0.99 1.0 1.15 1.52 0.56
0.83 0.6 -0.99 -1.42 -1.03 -1.15 0.49 -0.61 -0.49 -1.04 -0.07 0.52 0.32 0.28 0.51 0.45
0.94 -0.18 -0.72 -1.31 -1.1 -0.81 0.28 -0.9 -1.4 -1.81 -0.69 -0.36 0.63 0.88 1.14 0.81
1.02 -0.04 -0.35 -1.42 -0.28 -0.08 0.62 -0.1 -1.27 -1.28 -0.41 -0.38 0.04 0.31 1.02 -0.05
0.08 -0.82 -0.06 -1.52 -0.07 -0.22 0.39 -0.78 -1.96 -2.39 -0.85 -0.53 0.61 0.85 1.67 0.21
0.86 -0.05 -0.26 -1.05 -0.33 -0.18 -0.15 -1.14 -1.01 -1.24 -0.24 0.0 0.3 0.61 1.07 0.31
0.68 -0.12 -1.74 -1.56 -1.12 -1.91 1.12 -0.08 -0.59 -0.29 0.2 0.01 0.14 0.59 0.6 0.3
0.89 -0.33 -1.43 -1.11 -2.77 -2.2 -0.25 -0.94 -0.81 -1.13 -0.58 -0.47 0.78 1.02 1.57 0.74
1.29 -0.4 -0.86 -1.59 -1.1 -0.88 0.41 -0.24 -1.18 -1.36 -0.27 -0.04 0.51 0.61 0.88 0.36
0.72 0.74 -0.55 -1.23 -0.22 -0.39 0.53 -0.44 -1.22 -1.91 -0.68 -0.18 0.21 0.65 0.76 0.19
0.25 -0.46 -0.52 -1.64 -0.7 -0.57 -0.09 -0.97 -1.48 -1.8 -0.37 -0.12 0.73 1.17 1.48 0.35
0.59 -0.3 -2.05 -2.35 -2.17 -1.61 0.22 -0.46 -0.25 -0.43 -0.04 -0.18 0.8 0.92 1.06 0.71
1.07 0.42 -0.96 -1.64 -0.52 -0.48 -0.37 -0.94 -1.24 -1.27 -0.64 -0.39 0.55 0.66 1.22 0.49
0.72 -0.64 -0.42 -1.25 -0.62 -0.42 0.31 -0.51 -0.91 -0.96 -0.25 -0.05 0.46 0.69 0.89 0.58
1.06 -0.39 -0.49 -1.53 -0.67 -0.58 0.22 -0.67 -1.02 -1.14 -0.34 -0.14 0.45 0.61 1.07 0.43
0.26 0.35 -1.7 -2.09 -1.65 -1.1 0.67 0.06 -0.23 -0.43 0.05 -0.03 0.45 0.8 0.95 -0.1
-0.21 -0.58 -0.17 -1.06 -0.45 -0.11 -0.17 -1.02 -2.55 -3.21 -1.84 -1.46 1.0 1.33 1.59 0.69
0.86 -0.67 -0.35 -1.24 -0.56 -0.25 -0.23 -0.73 -1.04 -0.9 -0.24 -0.04 0.41 0.73 1.17 0.37
0.35 -0.21 0.1 -0.74 -0.21 -0.13 0.24 -0.64 -1.76 -1.87 -0.81 -0.17 0.41 0.79 1.18 0.31
0.6 -0.52 -0.19 -0.62 -0.39 -0.11 -0.03 -0.91 -1.26 -1.6 -0.3 -0.0 0.47 0.78 0.97 0.52
0.66 -0.99 0.12 -1.13 -0.22 -0.24 0.42 -0.63 -2.36 -2.52 -1.23 -0.56 0.5 1.04 1.37 0.2
0.55 -0.67 0.39 -0.99 0.07 -0.1 0.55 -0.62 -2.83 -3.04 -1.27 -0.45 0.34 0.86 1.14 0.38
-0.21 0.75 -0.48 -0.7 -0.1 -0.47 0.43 -0.4 -0.12 -0.65 0.21 0.95 -0.44 -0.25 0.42 -0.32
0.68 0.02 -0.91 -0.8 -0.57 -0.26 0.2 -0.14 0.22 0.08 -0.48 0.07 -0.26 0.35 0.59 0.16
0.48 -0.25 -0.33 -0.89 -0.33 -0.17 -0.02 -1.1 -0.62 -0.45 0.38 0.79 -0.05 0.31 0.63 0.18
0.73 0.2 0.45 -0.31 -0.07 0.15 0.29 -0.89 -1.1 -1.4 -0.66 -0.17 -0.02 0.25 0.85 -0.26
-0.02 0.01 -0.88 -1.34 -0.69 -0.5 -0.5 -1.32 -1.51 -1.72 -1.21 -1.25 1.12 1.15 1.52 0.9
0.78 -0.67 -0.24 -0.99 -0.42 -0.08 -0.25 -0.91 -0.58 -0.54 -0.18 -0.03 0.28 0.8 0.88 0.3
0.23 -0.21 -0.72 -1.4 -0.51 -0.43 0.54 -0.09 -0.69 -0.51 -0.02 0.32 0.26 0.49 0.8 0.31
0.36 -0.38 -0.39 -0.38 -0.16 0.42 0.29 -1.13 -0.9 -0.65 0.13 -0.44 0.28 0.53 0.67 0.33
1.1 0.22 -0.92 -1.76 -0.93 -0.97 0.3 -0.91 -0.73 -0.21 0.14 0.47 0.2 0.36 0.56 0.26
1.27 -0.97 -1.23 -1.84 -2.29 -2.09 -0.49 -0.95 -1.67 -1.05 -1.97 -1.63 0.9 1.34 1.66 0.81
0.31 -0.52 0.24 -0.56 0.02 0.22 -0.83 -1.36 -3.0 -3.7 -2.22 -1.73 0.85 1.2 1.47 0.55
0.76 0.04 -0.94 -1.12 -1.16 -1.05 -0.12 -0.33 -0.37 -0.87 -0.44 -0.18 0.67 0.76 0.98 0.54
0.54 0.05 -0.86 -1.07 -0.69 -0.42 -0.0 -0.79 -0.78 -0.49 0.17 0.08 0.42 0.59 0.78 0.59
0.84 0.8 -0.41 -0.53 0.06 0.06 0.18 -0.43 -0.34 -0.77 -0.23 0.3 -0.33 -0.17 0.15 -0.29
0.41 0.14 -0.58 -0.84 -0.56 -0.28 0.49 -0.28 -0.09 -0.05 0.16 0.27 -0.16 0.19 0.65 -0.39
0.62 0.76 -0.14 -0.71 0.16 -0.04 0.2 -0.66 -0.77 -1.58 -0.04 0.42 -0.09 0.13 0.28 -0.16
1.15 -0.11 -1.01 -1.13 -0.71 -0.65 -0.15 -0.69 -0.77 -1.11 -0.35 -0.19 0.46 0.82 0.85 0.56
0.86 -0.3 0.0 -0.92 -0.19 -0.15 0.22 -0.44 -1.43 -1.78 -0.59 -0.31 0.37 0.6 0.97 0.33
1.2 -0.55 -0.11 -1.02 -0.43 -0.22 0.15 -0.64 -1.55 -1.83 -0.58 -0.4 0.48 0.58 1.04 0.33
0.21 -0.19 -0.89 -1.61 -0.87 -0.89 0.53 -0.05 0.05 -0.1 -0.24 -0.02 0.43 0.22 1.07 0.26
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0.77 -0.66 0.1 -0.33 -0.11 0.03 0.25 -0.81 -1.38 -1.7 -0.54 -0.37 0.45 0.49 1.04 0.15
1.07 -0.16 -0.27 -1.33 -0.33 -0.37 0.24 -0.59 -1.71 -2.14 -1.08 -0.87 0.61 0.92 1.34 -0.2
0.11 -1.72 -1.19 -2.07 -1.11 -1.27 0.35 -0.92 -3.94 -3.28 -1.22 -0.98 1.21 1.48 1.65 0.92
0.71 0.71 -0.75 -1.04 -0.59 -0.63 0.86 0.02 -0.24 -0.36 0.23 0.61 -0.62 -0.43 -0.07 -0.25
0.43 0.1 -0.39 -1.28 -0.95 -0.64 0.24 -0.66 -1.7 -2.14 -0.51 -0.34 0.76 1.09 1.21 0.34
0.98 -0.18 -0.92 -1.39 -1.22 -0.92 -0.21 -0.81 -1.0 -1.55 -0.3 -0.09 0.59 0.89 1.35 0.42
0.78 -0.31 -0.44 -1.12 -1.11 -0.95 0.36 -0.41 -0.69 -1.07 -0.14 0.35 0.41 0.72 1.03 -0.05
0.56 -0.04 0.15 -0.49 0.18 0.02 -0.1 -0.7 -2.57 -2.96 -1.83 -1.44 0.69 0.86 1.28 0.3
0.63 -0.06 -0.85 -1.84 -0.9 -0.79 -0.96 -1.75 -2.72 -3.01 -1.8 -1.28 1.11 1.39 1.78 0.64
0.98 -0.07 -0.08 -0.96 -0.23 -0.16 0.63 -0.58 -0.45 -0.8 0.1 -0.05 -0.36 -0.02 0.7 -0.13

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.