1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_106 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - Leiboff and Hake (2019))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
18.23 11.1 49.95 45.81 45.75 50.62 0.55 0.28 1.61 12.42 19.16 25.18 0.0 0.0 1.08 0.0
1.32 1.75 85.76 116.84 106.15 152.76 5.83 1.88 13.33 14.31 36.81 24.01 1.02 0.68 6.56 0.13
1.71 29.12 73.69 98.44 124.93 108.22 6.79 4.82 22.33 50.57 48.26 41.6 0.26 1.36 5.18 0.48
0.0 0.05 0.29 0.18 0.0 0.35 0.27 0.0 0.0 0.0 0.46 0.43 0.0 0.0 1.05 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0
0.0 0.09 0.51 0.46 1.03 1.21 4.19 11.62 0.33 0.34 14.44 18.53 0.82 10.69 22.98 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.18 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0
0.0 0.0 0.4 0.0 0.11 0.0 0.12 0.03 0.0 0.16 0.0 0.0 0.37 0.0 0.73 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0
0.0 0.0 156.05 82.82 76.85 32.98 1.86 0.19 0.0 0.0 7.67 29.81 0.0 0.12 0.51 0.0
0.0 0.0 21.88 40.2 63.17 2.81 2.76 0.0 0.0 0.0 0.05 0.24 0.0 0.11 0.48 0.0
0.0 0.0 0.39 0.77 3.13 1.25 4.96 0.03 18.22 9.45 0.13 0.21 0.0 0.05 1.24 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0
10.1 1.68 233.95 272.19 174.22 91.48 4.76 4.87 8.0 2.12 6.07 6.38 0.74 0.39 1.66 0.19
0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.11 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0
0.12 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.19 0.09
0.0 0.0 0.22 1.95 0.84 4.17 1.43 0.01 0.0 0.0 1.56 0.33 0.0 0.0 0.7 0.0
83.48 0.39 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0
0.0 0.0 0.61 1.66 0.28 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.15 0.0 0.0 0.37 0.0
0.0 0.0 6.03 17.88 10.39 0.9 0.25 0.0 0.0 0.0 0.07 0.33 0.0 0.08 0.33 0.0
77.25 48.4 87.31 125.53 72.17 93.6 16.28 20.41 13.22 4.67 21.57 20.39 0.92 5.31 11.45 1.13
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.57 0.0
0.62 2.17 15.09 14.03 12.12 0.25 1.48 0.78 1.51 0.94 0.0 0.15 2.08 5.04 43.46 3.64
0.1 4.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.51 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.21
1.46 6.41 3.09 6.02 3.6 7.93 3.87 1.92 5.46 21.37 4.91 4.39 4.16 5.39 6.87 6.59
0.0 0.0 10.28 14.98 21.24 5.63 0.08 0.0 0.0 0.0 5.91 12.06 0.61 0.5 3.28 0.0
6.25 0.24 3.1 3.24 3.41 2.51 2.75 3.23 0.15 0.57 0.24 0.77 0.47 0.75 3.15 1.3
0.0 0.0 0.27 0.47 1.21 1.08 0.32 0.1 0.0 1.06 0.63 1.5 0.61 0.0 1.2 0.0
0.37 1090.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.51 0.0
0.47 2.0 240.51 194.31 124.43 131.16 76.0 11.7 67.76 73.72 43.22 41.8 0.0 0.0 0.55 0.0
63.3 33.84 6.89 5.87 8.77 9.34 9.85 8.47 3.94 3.98 5.57 8.06 2.83 1.56 6.96 1.39
11.81 24237.4 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.9 0.0
3.57 0.92 1.2 1.45 0.78 1.27 1.34 0.91 0.8 1.78 5.3 1.4 4.8 2.68 4.53 5.25
0.0 0.06 0.37 0.43 3.78 3.75 20.64 1.1 0.41 0.24 3.71 1.36 0.0 0.0 0.91 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 11.75 3.02 49.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0
0.0 1.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0
1.39 1.95 3.44 2.2 1.17 0.93 0.39 0.09 0.24 0.25 1.55 0.72 1.16 3.25 9.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0
0.07 0.15 0.0 0.14 0.02 0.02 0.0 0.01 0.36 0.03 0.0 0.03 0.08 0.04 0.82 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.08 0.0
0.12 0.78 0.0 0.0 0.02 0.0 0.11 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
19.83 2.85 4.25 6.21 4.39 8.56 1.12 1.3 3.92 5.02 1.96 1.78 8.44 8.96 19.13 8.04
10.19 18.48 0.0 0.18 0.0 0.41 0.0 0.21 10.83 5.72 0.68 0.84 0.0 0.0 1.0 0.0
12.08 0.03 2.79 3.41 0.05 1.42 0.37 0.07 0.0 0.06 0.0 0.06 0.0 0.0 0.31 0.0
0.14 0.29 117.02 170.68 722.4 162.64 81.87 238.5 95.09 37.93 8.57 31.85 0.1 0.52 5.33 0.0
0.0 0.21 0.04 0.04 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.1 0.33 0.0
0.24 0.02 57.14 82.25 81.79 47.6 19.98 2.96 2.44 1.8 9.02 12.68 0.13 0.12 2.53 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.36 0.82 0.04 0.0 0.0 0.04 0.71 0.0
0.0 0.32 517.13 318.44 231.85 131.14 68.8 93.93 0.13 1.53 128.32 109.01 0.0 0.0 0.22 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0
0.0 0.0 0.57 0.87 1.38 0.4 2.27 0.01 0.0 0.0 1.16 0.6 0.0 0.0 0.3 0.0
111.3 3.12 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.72 2.71 0.15
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.75 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0
2.05 0.46 35.37 52.17 57.42 61.15 13.36 5.73 1.21 0.49 6.69 6.84 10.38 17.56 41.85 9.28
213.06 0.07 0.98 0.45 0.28 0.5 0.13 0.0 0.08 0.0 0.08 0.0 16.2 17.6 106.53 5.49
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0
0.46 0.04 1.89 2.35 3.68 2.3 0.27 0.12 0.73 1.94 0.29 0.36 0.58 1.02 3.62 1.16
0.21 0.11 7.2 6.59 1.2 3.42 1.08 9.66 7.44 12.4 0.42 3.58 0.0 0.0 0.77 0.0
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 34.99 63.74 101.79 5.14
0.1 1.69 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.99 0.0
193.51 4.22 0.0 0.14 0.0 0.0 0.02 5.68 0.22 0.17 0.12 0.0 8.12 8.31 25.58 6.55
0.61 39.01 0.0 0.12 0.0 0.0 0.24 1.2 15.57 24.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0
5.42 3.41 10.51 18.97 16.01 21.89 18.57 1.63 11.66 20.22 36.08 18.73 2.1 2.31 4.03 2.32
11.18 5.3 7.7 9.02 21.07 11.75 10.33 5.4 6.51 5.79 15.05 14.16 3.5 2.61 5.44 4.82
0.09 0.0 0.23 0.03 11.26 2.4 0.02 0.95 0.04 0.08 7.66 7.65 0.0 0.0 0.38 0.0
0.0 0.08 0.77 0.16 8.67 1.52 3.42 0.41 2.96 2.45 0.0 0.39 0.0 0.44 5.6 0.0
0.02 0.0 8.31 1.0 0.38 0.34 0.0 0.09 0.57 6.27 0.0 0.05 0.0 0.0 0.24 0.0
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.67 0.0
17.71 0.0 1.05 1.37 1.94 4.81 1.62 1.37 0.0 0.0 0.19 0.24 0.0 0.0 0.6 0.0
0.02 0.31 2.53 2.1 2.29 1.57 0.35 0.65 0.37 0.0 1.06 0.2 1.47 1.57 7.0 1.73
2.03 0.18 0.76 1.29 2.94 1.4 0.21 1.7 0.0 0.12 0.0 0.89 3.27 4.03 13.82 4.27
0.02 0.19 0.41 1.19 0.49 1.16 1.21 40.26 54.49 29.86 0.39 0.43 0.0 0.07 0.91 0.0
0.0 1.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.2 0.0
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0
0.11 3.72 8.42 15.75 80.01 37.83 0.21 0.36 0.34 0.1 0.31 0.82 0.37 0.52 4.12 0.23
0.0 0.0 0.23 0.0 0.19 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.42 0.0
0.27 0.07 0.14 0.15 0.03 0.02 0.01 0.13 7.13 2.56 0.15 0.03 3.79 4.21 11.21 6.55
14.02 0.95 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.94 5.46 15.56 1.66
0.06 0.0 0.15 0.25 0.43 0.34 0.03 0.03 16.83 40.95 5.44 4.32 0.0 0.0 0.73 0.0
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0
35.78 368.55 5.61 8.38 11.77 8.46 38.73 158.35 22.11 18.33 17.13 35.04 0.0 0.0 1.62 0.0
26.83 0.3 54.54 18.39 10.78 2.37 0.0 0.1 0.0 0.44 33.99 9.1 0.0 0.71 2.69 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.73 0.0
1.32 0.4 0.52 0.78 0.26 0.16 0.19 0.38 1.55 2.42 4.13 1.01 4.48 5.32 14.09 3.62
0.43 0.0 172.37 175.11 658.68 234.04 2.71 0.64 14.76 9.98 35.05 30.91 0.0 0.0 1.81 0.0
18.13 0.44 0.07 0.09 0.04 0.1 0.29 0.02 0.37 0.61 0.96 0.21 6.29 6.76 16.83 1.72
0.73 1.35 0.29 0.29 0.34 0.92 0.51 1.78 2.9 1.54 1.95 0.24 11.83 10.74 21.26 10.93
0.1 0.23 2.68 1.96 7.91 12.24 0.32 0.13 0.11 0.16 2.82 2.59 0.0 0.72 1.32 0.0
39.53 0.04 0.03 0.0 0.19 0.06 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 2.78 0.0
0.68 0.0 44.88 41.67 31.28 48.38 1.16 0.05 0.0 0.06 2.62 4.44 0.0 0.0 1.82 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0
0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 2.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 8.44 32.34 0.46 0.18 0.0 0.0 0.18 0.0
0.0 0.0 0.89 1.58 0.0 0.0 10.08 0.17 0.0 0.0 0.29 0.13 0.0 0.0 0.65 0.0
0.0 0.03 0.0 0.15 0.05 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0
0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0
6.22 1.38 0.0 0.65 0.0 0.32 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0
0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.35 14.27 10.7 0.26 0.06 0.0 0.0 0.3 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)