1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_106 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - Leiboff and Hake (2019))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
0.36 0.22 0.99 0.9 0.9 1.0 0.01 0.01 0.03 0.25 0.38 0.5 0.0 0.0 0.02 0.0
0.01 0.01 0.56 0.76 0.69 1.0 0.04 0.01 0.09 0.09 0.24 0.16 0.01 0.0 0.04 0.0
0.01 0.23 0.59 0.79 1.0 0.87 0.05 0.04 0.18 0.4 0.39 0.33 0.0 0.01 0.04 0.0
0.0 0.04 0.27 0.17 0.0 0.33 0.26 0.0 0.0 0.0 0.44 0.41 0.0 0.0 1.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.02 0.04 0.05 0.18 0.51 0.01 0.01 0.63 0.81 0.04 0.46 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.54 0.0 0.15 0.0 0.17 0.04 0.0 0.22 0.0 0.0 0.51 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.53 0.49 0.21 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.35 0.64 1.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.02 0.04 0.17 0.07 0.27 0.0 1.0 0.52 0.01 0.01 0.0 0.0 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.04 0.01 0.86 1.0 0.64 0.34 0.02 0.02 0.03 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.09 0.0 0.0 0.1 0.18 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.63 0.09 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.2 0.0 0.0 0.0 0.51 0.24 1.0 0.47
0.0 0.0 0.05 0.47 0.2 1.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.37 0.08 0.0 0.0 0.17 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.37 1.0 0.17 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.0 0.0 0.23 0.0
0.0 0.0 0.34 1.0 0.58 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0
0.62 0.39 0.7 1.0 0.57 0.75 0.13 0.16 0.11 0.04 0.17 0.16 0.01 0.04 0.09 0.01
0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.01 0.05 0.35 0.32 0.28 0.01 0.03 0.02 0.03 0.02 0.0 0.0 0.05 0.12 1.0 0.08
0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.05
0.07 0.3 0.14 0.28 0.17 0.37 0.18 0.09 0.26 1.0 0.23 0.21 0.19 0.25 0.32 0.31
0.0 0.0 0.48 0.71 1.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.57 0.03 0.02 0.15 0.0
1.0 0.04 0.5 0.52 0.55 0.4 0.44 0.52 0.02 0.09 0.04 0.12 0.08 0.12 0.5 0.21
0.0 0.0 0.18 0.31 0.81 0.72 0.21 0.06 0.0 0.71 0.42 1.0 0.41 0.0 0.8 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.01 1.0 0.81 0.52 0.55 0.32 0.05 0.28 0.31 0.18 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.53 0.11 0.09 0.14 0.15 0.16 0.13 0.06 0.06 0.09 0.13 0.04 0.02 0.11 0.02
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.67 0.17 0.23 0.27 0.15 0.24 0.25 0.17 0.15 0.34 1.0 0.26 0.9 0.5 0.86 0.99
0.0 0.0 0.02 0.02 0.18 0.18 1.0 0.05 0.02 0.01 0.18 0.07 0.0 0.0 0.04 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.06 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0
0.15 0.21 0.38 0.24 0.13 0.1 0.04 0.01 0.03 0.03 0.17 0.08 0.13 0.36 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.08 0.19 0.0 0.17 0.03 0.03 0.0 0.01 0.44 0.04 0.0 0.04 0.1 0.05 1.0 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.15 1.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.15 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0
1.0 0.14 0.21 0.31 0.22 0.43 0.06 0.07 0.2 0.25 0.1 0.09 0.43 0.45 0.96 0.41
0.55 1.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.59 0.31 0.04 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0
1.0 0.0 0.23 0.28 0.0 0.12 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.16 0.24 1.0 0.23 0.11 0.33 0.13 0.05 0.01 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.63 0.13 0.11 0.15 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.32 1.0 0.0
0.0 0.0 0.69 1.0 0.99 0.58 0.24 0.04 0.03 0.02 0.11 0.15 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.44 1.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.87 0.0
0.0 0.0 1.0 0.62 0.45 0.25 0.13 0.18 0.0 0.0 0.25 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.25 0.38 0.61 0.17 1.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.27 0.0 0.0 0.13 0.0
1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.03 0.01 0.58 0.85 0.94 1.0 0.22 0.09 0.02 0.01 0.11 0.11 0.17 0.29 0.68 0.15
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.5 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.12 0.01 0.51 0.64 1.0 0.62 0.07 0.03 0.2 0.53 0.08 0.1 0.16 0.28 0.98 0.32
0.02 0.01 0.58 0.53 0.1 0.28 0.09 0.78 0.6 1.0 0.03 0.29 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.63 1.0 0.05
0.05 0.85 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.13 0.03
0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.4 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.15 0.09 0.29 0.53 0.44 0.61 0.51 0.05 0.32 0.56 1.0 0.52 0.06 0.06 0.11 0.06
0.53 0.25 0.37 0.43 1.0 0.56 0.49 0.26 0.31 0.27 0.71 0.67 0.17 0.12 0.26 0.23
0.01 0.0 0.02 0.0 1.0 0.21 0.0 0.08 0.0 0.01 0.68 0.68 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.01 0.09 0.02 1.0 0.18 0.39 0.05 0.34 0.28 0.0 0.05 0.0 0.05 0.65 0.0
0.0 0.0 1.0 0.12 0.05 0.04 0.0 0.01 0.07 0.75 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
1.0 0.0 0.06 0.08 0.11 0.27 0.09 0.08 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.04 0.36 0.3 0.33 0.22 0.05 0.09 0.05 0.0 0.15 0.03 0.21 0.22 1.0 0.25
0.15 0.01 0.06 0.09 0.21 0.1 0.02 0.12 0.0 0.01 0.0 0.06 0.24 0.29 1.0 0.31
0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.74 1.0 0.55 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.05 0.11 0.2 1.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.05 0.0
0.0 0.0 0.54 0.0 0.44 0.0 0.21 0.01 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 1.0 0.0
0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.64 0.23 0.01 0.0 0.34 0.38 1.0 0.58
0.9 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.35 1.0 0.11
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.41 1.0 0.13 0.11 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.1 1.0 0.02 0.02 0.03 0.02 0.11 0.43 0.06 0.05 0.05 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.49 0.01 1.0 0.34 0.2 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.62 0.17 0.0 0.01 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.09 0.03 0.04 0.06 0.02 0.01 0.01 0.03 0.11 0.17 0.29 0.07 0.32 0.38 1.0 0.26
0.0 0.0 0.26 0.27 1.0 0.36 0.0 0.0 0.02 0.02 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.02 0.03 0.05 0.01 0.35 0.37 0.93 0.09
0.03 0.06 0.01 0.01 0.02 0.04 0.02 0.08 0.14 0.07 0.09 0.01 0.56 0.51 1.0 0.51
0.01 0.02 0.22 0.16 0.65 1.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.23 0.21 0.0 0.06 0.11 0.0
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.0
0.01 0.0 0.93 0.86 0.65 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.0 0.0 0.04 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 1.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.09 0.16 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.06 0.0 0.28 0.1 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
1.0 0.22 0.0 0.1 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.75 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)