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Heatmap: Cluster_116 (Sorghum bicolor HCCA coexpression clusters - Leiboff and Hake (2019))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
stage A1 (Dhaka et al., 2020)
stage A3 (Dhaka et al., 2020)
M-81E strain-control (Sun et al., 2020)
M-81E strain-salt (Sun et al., 2020)
Roma strain-control (Sun et al., 2020)
Roma strain-salt (Sun et al., 2020)
root (Murray et al., 2022)
shoot system (Murray et al., 2022)
119 days old-Postflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
84 days old-Preflowering drought stress (Varoquaux et al., 2019)
35 days old-control (Varoquaux et al., 2019)
Dev Stage 3 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 2 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 1 (Leiboff et al., 2019)
Dev Stage 4 (Leiboff et al., 2019)
-0.91 -1.72 0.82 0.76 1.1 0.52 -0.63 -0.82 -0.61 -0.09 0.17 0.51 -0.16 -0.7 -1.39 -0.16
-1.58 -0.48 -1.54 -1.85 -1.12 -0.25 -0.67 -0.25 1.34 2.22 -0.58 -0.61 0.04 -0.73 -1.26 -0.02
-0.46 -2.21 0.17 0.56 0.36 1.06 0.14 -0.36 0.31 0.31 0.87 0.04 -0.42 -1.33 -2.15 -0.96
-1.27 -2.53 1.66 1.69 0.58 0.73 -0.64 -0.84 -1.94 -1.14 -0.23 -0.86 -0.14 -1.08 -1.14 -0.5
1.23 -0.76 -1.51 -2.39 -0.76 -0.03 -0.37 -1.43 -1.89 -0.36 0.8 -0.35 1.01 0.45 0.09 0.84
-0.4 -1.1 -0.35 -0.75 -0.95 -0.41 -0.24 0.72 0.3 0.87 0.42 0.03 0.28 -0.47 -0.43 0.62
0.28 -2.0 -0.89 -0.46 -0.47 0.0 0.84 -0.41 -0.21 0.69 0.87 -0.53 0.47 -0.17 -0.87 0.23
0.44 -1.11 0.21 0.76 0.19 -0.02 -0.52 -1.19 -0.56 0.18 0.52 -0.55 0.34 -0.12 -0.82 0.46
-0.59 -1.29 -0.32 -0.31 -0.44 -0.19 -0.05 -0.71 0.33 0.53 0.89 0.53 0.42 -0.21 -0.55 0.33
-0.2 -2.08 0.01 -0.02 0.21 0.34 0.13 -0.13 -0.94 -0.38 0.56 0.13 0.6 -0.02 -0.5 0.49
-0.33 -1.68 0.39 0.62 0.4 0.58 -0.31 -1.12 -0.38 0.0 1.11 0.2 0.14 -0.59 -1.45 -0.39
-1.32 -1.35 0.14 0.68 0.84 0.84 0.57 0.17 -3.29 -2.84 1.18 0.03 -0.25 -0.64 -1.29 -0.16
-0.33 -2.26 0.07 0.03 0.53 0.8 -0.1 -0.47 -0.25 0.07 0.8 0.01 0.65 -0.54 -1.31 -0.35
0.36 -1.24 -0.3 0.4 0.23 0.37 0.37 -0.4 -0.11 -0.13 0.71 -0.22 0.32 -0.57 -1.06 -0.16
0.7 -1.23 -0.91 -1.7 -0.56 -0.36 -0.49 -1.03 -2.18 -1.95 0.17 -0.9 1.42 0.9 0.54 1.21
-0.11 -0.71 -0.43 -0.19 0.01 0.34 0.33 -0.62 0.23 0.51 1.09 0.36 -0.3 -0.85 -1.32 -0.15
-1.33 -2.69 -0.74 -0.23 0.19 0.1 1.47 0.71 1.19 1.31 -0.37 -0.78 -1.15 -1.88 -2.64 -1.42
-1.67 -1.77 -0.11 0.24 -0.48 -0.34 0.91 0.44 0.5 0.72 1.01 0.25 -0.52 -1.08 -1.31 -0.48
-0.3 -2.54 -0.62 -0.15 -0.13 0.54 0.57 -0.19 -0.54 0.02 1.14 0.03 0.7 -0.41 -1.08 -0.05
0.37 0.33 -0.47 -0.15 0.15 -0.5 0.85 0.1 -0.38 -0.43 -0.11 0.05 0.15 -0.4 -0.35 0.01
0.49 -2.59 -1.06 -0.74 -1.0 0.41 0.37 0.1 0.3 -0.31 0.61 -0.53 0.68 0.0 -0.42 0.62
-0.34 -1.63 0.53 0.97 0.99 1.07 -0.21 -0.51 -0.93 -0.29 0.62 0.11 -0.26 -1.37 -2.37 -1.1
-0.57 -1.0 0.64 0.98 0.41 0.46 -0.22 -0.54 -0.09 0.29 0.65 0.38 -0.61 -1.19 -1.7 -0.69
-0.7 -1.22 0.75 1.14 0.69 0.75 -0.26 -0.7 -0.09 0.2 0.46 0.15 -0.81 -1.42 -1.74 -0.97
-0.69 -1.77 0.23 0.87 -0.03 1.43 -0.15 -0.59 0.21 0.38 0.59 -0.19 -0.31 -1.27 -2.35 -0.79
-0.05 -1.57 -0.66 -0.19 -0.58 0.31 0.11 0.16 0.12 0.47 0.59 -0.46 0.76 -0.05 -0.73 0.16
-0.21 -1.91 0.05 0.72 0.41 0.88 0.15 -0.57 -0.39 0.36 0.7 -0.22 -0.04 -1.04 -1.68 -0.1
-0.12 -1.13 0.56 0.88 0.69 0.53 -0.46 -0.77 -0.14 0.2 0.08 -0.4 -0.04 -0.68 -0.94 -0.07
0.11 -0.75 -0.04 0.21 0.08 0.49 0.02 -0.28 0.01 0.24 0.66 -0.53 0.18 -0.31 -0.92 -0.04
-0.16 -1.59 0.68 1.05 0.69 0.83 -0.07 -0.38 -0.25 -0.03 0.46 -0.48 -0.43 -1.29 -1.62 -0.72
-3.7 -4.38 -6.18 - -0.03 -1.48 -0.81 -0.92 -6.21 -5.51 - - 2.17 1.15 1.3 2.07
0.04 -1.15 -0.54 0.27 -0.1 0.67 0.27 0.08 0.12 0.59 0.85 -0.3 -0.09 -0.83 -1.57 -0.32
0.14 -2.44 -0.66 -0.72 -0.02 0.55 0.4 0.05 -2.06 -1.54 1.17 0.59 0.65 -0.01 -0.83 0.26
-1.29 -3.5 -0.38 0.36 0.58 0.98 0.04 0.9 -3.77 -3.45 -1.3 -0.42 1.06 -0.06 0.05 0.75
-0.62 0.19 -1.43 -1.4 -0.59 -0.69 -0.51 -0.87 -0.17 1.92 0.4 0.62 0.02 -0.42 -0.82 0.1
0.08 -1.82 -0.53 -0.18 -0.07 0.45 0.21 0.05 -0.3 -0.02 0.99 0.0 0.42 -0.07 -1.0 0.01
0.07 -0.71 -0.24 -0.59 -0.08 -0.17 -0.34 -0.46 0.37 0.23 0.41 0.31 0.4 0.03 -0.29 0.36
-0.16 -1.34 0.4 0.44 0.71 0.73 -0.17 -0.65 -1.09 -1.08 0.65 0.52 0.28 -0.53 -1.01 -0.21
0.53 -1.22 -0.6 -0.65 -0.31 0.36 0.21 -0.65 -1.16 -0.42 0.4 -0.05 0.86 0.23 -0.02 0.59
0.59 -0.94 0.04 0.63 -0.09 0.48 -0.22 0.3 0.25 0.68 0.4 -0.47 -0.42 -1.25 -1.59 -0.61
0.07 -1.25 0.62 1.02 0.53 0.77 -0.37 -0.58 -0.25 -0.05 0.33 -0.35 -0.23 -1.03 -1.04 -0.53
-0.27 -1.09 0.24 0.71 0.32 0.4 -0.12 -0.66 -0.42 -0.16 0.16 0.14 0.26 -0.1 -0.5 0.1
-0.04 -0.41 -2.76 -1.72 -1.35 -0.81 0.31 -0.16 0.59 1.2 0.66 -0.03 0.6 -0.33 -0.83 0.57
1.26 -0.28 -1.64 -1.22 -0.7 -0.6 -0.16 -0.48 -2.37 -1.62 0.14 0.22 1.18 0.25 -0.77 1.2
-0.45 -1.24 0.91 0.94 0.77 0.84 -0.35 -0.68 -0.28 0.11 0.49 0.07 -0.84 -1.6 -1.91 -0.65
0.38 -1.04 -0.77 -0.73 -0.52 0.07 -0.13 -0.41 -0.44 0.12 0.29 -0.08 0.87 0.33 0.07 0.56
0.55 -0.83 -0.48 -0.1 -0.51 -0.57 0.04 0.09 0.46 0.16 -0.58 -0.98 0.73 0.1 -0.3 0.71
-0.04 -1.51 0.39 0.72 0.26 0.64 -0.22 -0.63 -0.44 0.16 0.77 -0.04 0.06 -0.62 -1.24 -0.28
-1.92 -2.47 1.49 1.77 0.86 1.63 -1.01 -1.55 -1.04 -0.55 -0.2 -1.32 -1.35 -2.24 -2.41 -1.47
-0.09 -1.49 0.79 0.77 0.39 0.29 -0.08 -0.67 -0.86 -0.41 0.88 0.36 0.08 -0.88 -1.7 -0.27
0.36 -1.28 -0.18 0.22 0.24 0.89 0.16 0.02 -0.45 -0.21 0.38 -0.65 0.38 -0.58 -1.03 0.13
-0.8 -1.14 -2.96 -2.78 -1.97 -2.25 -1.35 0.37 1.67 2.15 -1.16 -1.17 0.53 -0.2 -0.91 0.25
1.0 -0.43 -0.68 -0.41 0.79 -0.22 0.12 0.58 -0.18 0.19 0.19 0.2 -0.17 -1.08 -1.46 -0.56
0.34 -0.36 -1.21 -1.17 -0.56 -0.24 -0.71 -1.14 -0.03 0.43 0.48 0.32 0.9 0.32 -0.15 0.59
0.45 -3.05 -0.31 -0.43 0.03 0.84 0.12 -0.71 -2.43 -1.11 0.41 -0.52 1.01 0.38 -0.14 0.63
-0.72 -1.92 -0.42 -0.52 -0.08 0.32 0.8 0.76 -1.11 -0.51 0.56 0.21 0.98 -0.37 -1.37 0.18
-0.02 -0.91 -0.25 0.11 0.09 0.38 0.28 -0.25 0.15 0.4 0.39 -0.49 0.25 -0.29 -0.79 0.15
-1.16 -1.75 0.19 0.57 0.28 0.75 0.11 -0.29 1.01 0.6 0.73 -0.62 -0.53 -1.09 -1.77 -0.86
0.21 -0.65 -1.02 -0.89 -0.69 -0.5 -0.42 -0.69 -0.1 0.29 0.37 0.12 0.79 0.38 0.04 0.91
-0.63 0.0 -1.12 -0.86 -0.34 -0.48 0.08 -1.04 0.52 0.42 0.83 0.6 0.31 -0.03 -0.49 0.36
-0.21 -0.91 0.36 0.92 0.32 0.27 0.04 -0.39 0.41 0.05 0.19 -0.44 0.08 -1.0 -0.97 -0.17
0.48 1.03 -0.49 -0.29 0.04 0.09 0.95 0.02 -1.73 -1.36 0.16 0.07 -0.02 -0.63 -0.73 -0.13
-0.86 -2.21 0.05 0.59 0.16 0.73 -0.13 -0.52 -0.2 0.38 0.8 -0.22 0.34 -0.33 -0.83 -0.14
-0.02 -1.24 -0.65 -0.98 -0.63 -0.01 -0.12 -1.14 0.07 0.62 0.81 0.41 0.68 -0.06 -0.42 0.54
-2.31 -1.8 1.37 1.81 0.98 0.89 -0.48 -0.98 -0.88 -0.78 0.18 -0.33 -1.29 -2.06 -2.01 -1.25
0.65 -1.55 -0.06 -0.39 -0.35 -0.35 -0.06 -0.7 -1.05 -1.11 -0.1 -0.47 0.92 0.43 0.54 0.94
0.58 -0.27 -0.88 -1.44 -0.51 -0.11 -0.06 -0.2 -0.53 -0.29 0.83 -0.15 0.62 0.08 -0.02 0.62
-0.74 -2.78 -0.7 -0.4 0.72 -0.25 0.26 -0.75 -0.34 -0.06 1.04 0.46 0.74 -0.06 -0.57 0.15
-1.5 -1.44 -1.06 -0.69 -0.37 -0.03 0.37 -0.19 -0.11 -0.27 0.98 -0.4 1.18 0.32 -0.44 0.61
0.38 -0.13 -1.44 -1.34 -0.57 0.18 -0.27 -1.52 -1.99 -0.39 1.08 0.66 0.72 0.31 -0.52 0.79
-0.71 -0.67 0.72 1.11 0.63 0.45 0.0 -0.42 0.37 0.47 0.55 -0.31 -1.21 -1.86 -2.14 -1.28
-0.47 -1.39 0.59 0.93 0.62 1.29 -0.61 -1.41 -1.45 -0.5 0.55 -0.43 0.44 -0.76 -1.3 -0.25
0.81 -0.99 -0.25 0.39 -0.23 0.27 0.19 -0.35 -0.31 -0.13 0.72 -0.29 0.42 -0.58 -0.99 -0.14
-0.55 -1.22 -0.24 0.17 -0.44 -0.15 0.92 0.47 0.35 0.57 0.8 -0.33 -0.12 -0.88 -1.46 -0.18
0.05 -1.04 0.42 0.76 0.36 0.48 0.1 -0.46 -0.0 0.34 0.4 -0.63 -0.14 -0.76 -1.32 -0.25
-1.47 -1.95 1.14 1.33 0.69 0.99 -0.31 -0.61 -0.06 0.31 0.54 -0.61 -1.23 -2.07 -2.15 -1.38
-0.15 -1.01 -1.35 -0.8 -0.72 -0.61 1.79 0.45 -0.98 -0.16 0.7 0.43 0.25 -0.38 -1.73 -0.15
0.31 -1.41 -0.56 -0.2 -0.92 0.04 0.75 0.22 -0.08 0.12 0.9 0.35 0.21 -0.35 -1.52 -0.04
-0.85 -1.7 -0.46 -0.16 -0.04 0.11 -0.19 -0.47 0.43 0.55 0.9 0.79 0.16 -0.36 -0.95 0.06
-0.27 -1.14 -0.56 -0.35 -0.08 0.67 -0.36 -0.36 -0.28 0.43 0.7 0.26 0.54 -0.13 -0.96 0.37
0.26 -2.06 -0.1 -0.41 -0.25 0.37 -0.04 -1.2 -0.1 0.24 0.67 -0.3 0.62 -0.03 -0.24 0.55
0.18 -1.37 -0.25 0.31 0.12 0.61 0.73 0.34 0.24 0.47 0.56 -0.76 -0.24 -0.94 -1.6 -0.92
-0.45 -0.91 0.47 0.97 0.51 0.92 -0.34 -0.5 -0.39 -0.3 0.48 -0.03 -0.0 -0.88 -1.44 -0.48
-0.07 -1.2 -0.92 -0.79 -0.5 -0.01 0.35 0.1 0.37 0.46 0.35 -0.68 0.7 0.12 -0.09 0.32
0.11 -2.27 0.02 -0.84 0.88 1.34 -1.21 -1.55 -2.92 -3.02 0.42 -0.41 1.22 0.18 -0.85 0.71
1.14 -2.48 0.06 -0.54 0.11 0.34 -0.98 -0.62 -4.3 -4.14 -2.08 -1.14 1.37 0.57 0.65 0.97
0.21 -1.32 -0.73 -0.33 -0.74 -0.32 -0.02 -0.37 -0.34 0.02 0.03 -1.02 1.03 0.66 0.16 0.88
-1.06 -2.17 -0.71 -0.44 -0.37 0.12 0.51 0.17 0.06 0.77 1.17 0.4 0.1 -0.52 -1.15 -0.01
-0.46 -1.69 0.59 0.86 0.44 0.85 0.36 0.21 -0.27 -0.25 0.3 -0.72 0.04 -1.12 -1.34 -0.62
-0.7 -2.25 0.17 0.42 0.49 0.8 0.05 0.15 0.14 0.52 0.51 -0.38 0.05 -0.7 -1.45 -0.55
-0.23 -0.95 -1.02 -0.73 -0.44 -0.53 0.44 -0.08 -0.45 -0.32 0.48 0.31 0.88 0.37 0.02 0.56
-1.07 -5.69 -0.28 -1.2 0.09 -0.71 0.4 0.7 - - -1.91 0.17 1.39 0.72 0.83 1.12
-0.2 -0.75 -0.08 0.57 0.73 0.6 0.08 -0.35 0.13 -0.61 0.64 -0.6 0.32 -0.83 -1.1 -0.23
-0.58 -1.41 -0.04 0.42 0.26 0.74 -0.4 -0.95 0.2 0.5 1.08 0.5 -0.33 -0.92 -1.5 -0.43
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-0.85 -1.42 0.44 0.81 0.62 0.07 0.35 -0.44 0.26 0.34 0.2 0.14 -0.2 -1.1 -0.76 -0.49
-0.08 -0.52 -0.1 0.47 -0.17 0.42 -0.32 -0.48 0.58 0.82 0.24 -0.24 0.01 -0.72 -1.12 -0.12
-0.54 -1.46 0.4 0.86 0.55 0.42 0.38 -0.24 0.24 0.5 0.75 0.25 -1.23 -1.71 -2.07 -1.21
-0.55 -0.8 0.67 1.13 0.55 0.38 -0.24 -0.52 -0.16 -0.05 0.59 0.27 -0.59 -1.24 -1.65 -0.58
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0.2 -1.0 -0.39 -0.06 -0.41 0.21 0.17 0.01 -0.11 -0.0 0.76 0.28 0.58 -0.57 -0.98 0.11
0.13 -2.89 0.25 0.09 0.42 0.76 -0.19 -0.78 -2.8 -1.81 0.26 -0.69 0.99 0.32 0.15 0.53
0.02 -1.0 0.13 0.53 0.34 0.74 0.29 -0.54 -1.34 -0.42 0.23 -0.64 0.55 -0.08 -0.85 0.24
-0.98 -2.47 0.46 0.68 0.21 0.13 0.22 -0.15 -0.36 -0.16 1.01 0.32 0.23 -0.42 -1.23 -0.43
-1.48 -0.65 0.29 0.29 0.01 -0.24 0.43 0.04 0.43 0.79 0.71 0.64 -0.54 -1.13 -1.56 -0.81
-0.41 -1.09 -0.31 0.3 -0.24 0.23 0.02 -0.61 0.08 0.31 0.58 -0.32 0.58 -0.05 -0.61 0.42
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-1.32 -5.48 -2.09 -2.61 -1.47 -1.26 -1.54 -0.2 -8.0 -5.77 -2.56 -1.69 1.88 1.26 1.5 1.91
-1.03 -2.63 0.95 1.52 1.12 0.79 0.65 -0.28 -4.07 -4.13 0.33 -0.19 -0.49 -1.12 -2.19 -0.72
0.23 -0.98 -0.24 0.36 -0.1 0.46 0.07 0.17 0.13 0.34 0.4 -0.58 0.66 -0.88 -1.48 -0.16
-0.36 -1.54 0.21 0.6 0.35 0.73 0.1 -0.31 -0.21 0.12 0.51 -0.16 0.15 -0.58 -1.0 -0.25
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-0.31 -1.87 0.21 0.53 0.18 0.8 -0.22 -1.03 -0.33 0.47 0.48 -0.03 0.32 -0.55 -0.61 -0.08
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0.15 -1.13 -0.08 0.16 0.18 0.29 0.16 -0.12 0.13 0.25 0.71 -0.02 0.1 -0.77 -1.15 -0.04
0.27 -1.27 0.01 0.2 0.29 0.55 0.11 -0.36 0.13 0.63 1.02 0.25 -0.62 -1.39 -2.16 -0.86
-0.54 -1.46 -0.42 0.07 -0.07 0.4 -0.25 -0.57 -0.0 0.27 0.52 -0.4 0.66 0.02 -0.18 0.57
-0.66 -1.29 0.01 0.41 0.25 0.06 0.93 0.07 -0.69 -0.1 1.03 0.56 -0.15 -0.83 -2.02 -0.6
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- - 2.72 1.94 1.09 -0.1 -0.5 -1.34 - - -10.35 -7.38 -0.65 -2.35 -2.86 -1.2
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-0.19 -1.58 0.43 0.95 0.37 0.59 -0.08 -0.21 -0.11 0.39 0.48 -0.95 -0.04 -0.7 -1.6 -0.26
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0.57 -0.26 0.2 0.54 -0.03 0.79 -0.14 -0.74 0.3 0.43 0.22 -0.09 -0.33 -1.04 -1.56 -0.87
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1.11 -1.94 -1.67 -1.93 -0.17 -1.73 -0.51 1.4 1.04 1.7 -0.02 -1.08 -0.82 -1.27 -1.98 -1.09
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-0.15 -1.81 -0.18 0.33 0.32 0.54 0.59 0.06 0.02 -0.01 1.02 0.52 -0.47 -1.34 -1.74 -0.89
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.